Pokémon Cristal es la continuación de Oro/Plata. aunque sea una version nueva, la trama solo presenta algunos cambios
El juego se centra en la aparición de 100 Pokémon, inexistentes en versiones anteriores, que provocarán más tiempo de juego necesario para completar el juego.
Ahora podremos hacernos con Raikou, Suicune y Entei, los nuevos Pokémon "importantes", junto con Ho-oh y Lugia. Ahora podremos completar la colección.